Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan (FPIK) Unhalu pada awalnya merupakan jurusan perikanan, Fakultas Pertanian Unhalu yang telah berdiri sejak 1995. Jurusan ini memiliki 2 Program Studi yaitu Program Studi Budidaya Peraian (BDP) dan Manajemen Sumberdaya Perairan (MSP). Pada Tanggal 17 April 2006 berdasarkan SK Dirjen DIKTI No: 1345/D/T/2006, Jurusan Perikanan ini berdiri sendiri menjadi fakultas baru dan termuda di Unhalu dengan nama Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan.
Dekan : Prof. Dr. Ir. La Ode Muhammad Aslan, M.Sc.
Pembantu Dekan I : Ir. Utama Kurnia Pengerang, M.Si.
Pembantu Dekan II : Ir. Abdul Haris Sarita, M.P
Pembantu Dekan III : Wa Iba, S.Pi., M.App.Sc
Pembantu Dekan IV : Ir. Abdurrahman Nurdin, M.Si
